Будем очищать через терминал Xubuntu:

sudo apt-get autoclean

очищает систему от .deb пакетов, которые более не нужны,

sudo apt-get autoremove

удаляем ненужные нам зависимости от уже удалённых пакетов,

sudo apt-get clean
Больше интересных материалов на Блоге очередного вебмастера